You can use Array # indexOf :
var array = [1,2,3,4,5];
console.log(array.indexOf(2)); // retorna 1
var inputs = document.querySelectorAll("input"); // obtem todos os inputs
var valores = []; // vetor para armanezar somente os valores. Esse vetor será usado para obter o minimo entre um conjunto de valores
// funcao que será chamada pelo botão verificar
function verificar(){
// forEach itera os inputs do formulario
inputs.forEach(item =>{
if (item.value) // se o valor do input for valido (não vazio, nem espacos em branco, nem NaN, etc
valores.push(parseFloat(item.value)); // empilha (adiciona) na lista de valores
});
var menorValor = Math.min.apply(null, valores); //usamos a função Math min para obter o menor valor de um conjunto de valores
console.log(valores.indexOf(menorValor));
}
<input type="text" /><br/>
<input type="text" /><br/>
<input type="text" /><br/>
<button onclick="verificar()">Verificar</button>