Insert multiple type file records into Mysql

foreach($_POST['fotos'] AS $indice => $valor) {
  $values .= " (NULL, '{$id_recuperado}', '{$valor}'),";
}

$values=substr($values, 0, -1);

 $sql_fotos = "INSERT INTO 'embarcacao_fotos' ('id', 'id_embarcacao', 'arquivo') VALUES $values";

  

By analyzing your code after having it indented in a more readable way, I checked that the logic is wrong. The foreach is within a for loop and thus the $values variable is being created in the wrong way. So I've refactored the code so that the upload and insert in the embarcacao_fotos table are executed correctly and with the mysqli _ *

<?php

//coloquei esse if mas você faça do modo que deva ser do seu interesse, eé da ultima chave de fechamento
if (isset($_POST['tipo'])) {

/**não devemos usar "mysql" pelo seu desenvolvimento ter sido descontinuado; a extensão se tornou obsoleta e essas funções não irão funcionar em futuras versões do PHP*/
//include_once("config.php");

//use mysqli ou PDO
$conn = new mysqli ("localhost", "Usuario", "Senha", "nome_DB");

$nome_embarcacao = $_POST['nome'];
$tipo = $_POST['tipo'];
$arquivo = $_POST['arquivo'];
$capacidade = $_POST['capacidade'];
$tamanho = $_POST['tamanho'];
$motorizacao = $_POST['motorizacao'];
$equipamentos = $_POST['equipamentos'];
$periodo_passeio = $_POST['periodo_passeio'];
$area_navegacao = $_POST['area_navegacao'];
$descricao = $_POST['descricao'];

//com mysqli
$sql = "INSERT INTO 'embarcacao' ('id', 'nome', 'tipo', 'arquivo', 'capacidade', 'tamanho', 'motorizacao', 'equipamentos', 'periodo_passeio', 'area_navegacao', 'descricao') VALUES (NULL, '$nome_embarcacao', '$tipo', '$arquivo', '$capacidade', '$tamanho', '$motorizacao', '$equipamentos', '$periodo_passeio', '$area_navegacao', '$descricao');";
$executa = mysqli_query($conn,$sql);

$id_recuperado = $conn->insert_id;

// inicia criação de pasta

mkdir("../assets/images/embarcacoes/$id_recuperado/", 0777, true);

// fim da criação da pasta
$uploaddir="../assets/images/embarcacoes/$id_recuperado/";

if($arquivo != "none") {// verifica campo foto 1
if (copy($_FILES['arquivo']['tmp_name'], $uploaddir . $_FILES['arquivo']['name'])) {
$varfoto01 = $_FILES['arquivo']['name'];

//com mysqli
$conn->query("UPDATE embarcacao set arquivo='$varfoto01' where 
id='$id_recuperado'"); 
}}

/************************************************************************************/
/********  daqui pra baixo faz upload e insert na tabela embarcacao_fotos ***********/
/************************************************************************************/

$j = 0;

// Pasta de destino das fotos
$caminhoDestino = "../assets/images/embarcacoes/$id_recuperado/";

$Fotos=$_FILES['fotos'];

    for ($i = 0; $i < count($Fotos['name']); $i++) {
        //nome e extensão do arquivo
        $nome = ($Fotos['name'][$i]);

        if($nome!=""){
            //constroi os values da declaração INSERT para a tabela embarcacao_fotos
            $values .= " (NULL, '{$id_recuperado}', '{$nome}'),";

             $extensoesValidas = array("jpeg", "jpg", "png", "gif");
             //basename() retorna apenas a parte que corresponde ao nome do arquivo.
             $ext = explode('.', basename($Fotos['name'][$i]));

             //end() avança o ponteiro interno de array até o seu último elemento, e retorna-o.
             $extensaoArquivo = end($ext);

             // Caminho completo de destino da foto
             $caminhoCompleto = $caminhoDestino.$nome;

             $j = $j + 1;
                if (($Fotos["size"][$i]>0) && in_array($extensaoArquivo, $extensoesValidas)) {
                    if (move_uploaded_file($Fotos['tmp_name'][$i], $caminhoCompleto)) {
                     echo $j. ').<span id="noerror">Imagem carregada com êxito!.</span><br/><img src="'.$caminhoCompleto.'" width="50px" height="50px" /><br/><br/>';
                    } else {
                     echo $j. ').<span id="error">Por favor, tente novamente!.</span><br/><br/>';
                    }
                } else {
                echo $j. ').<span id="error">***Tamanho ou tipo de arquivo inválido***</span><br/><br/>';
                }
        }
    }

    //retira a ultima virgula
    $values=substr($values, 0, -1);

    //declaração insert 
    $sql_fotos = "INSERT INTO 'embarcacao_fotos' ('id', 'id_embarcacao', 'arquivo') VALUES $values";
    //executa a query
    $executa = mysqli_query($conn,$sql_fotos);

    mysqli_close($conn); 


}
?>

<script src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/3.2.1/jquery.min.js"></script><script>$(document).ready(function(){varcampos_max=10;//maxde10camposvarx=1;//camposiniciais$('#add_field').click(function(e){e.preventDefault();//prevenirnovosclicksif(x<campos_max){$('#listas').append('<div>\<inputname="fotos[]" type="file" class="form-control" aria-describedby="fileHelp" style="width: 70%;">\
                            <a href="#" class="remover_campo">Remover</a>\
                            </div>');
                    x++;
            }
    });

    // Remover o div anterior
    $('#listas').on("click",".remover_campo",function(e) {
            e.preventDefault();
            $(this).parent('div').remove();
            x--;
    });
});
</script>


<form class="form-horizontal m-t-40" autocomplete="off" action="?pg=enviar_embarcacao" method="post" enctype="multipart/form-data" novalidate>
  <div class="form-group">
<label>Tipo Embarcação</label>
<select name="tipo" class="custom-select col-12" id="inlineFormCustomSelect">
  <option selected>Selecione o tipo...</option>
  <option value="1">Alugar</option>
  <option value="2">Vender</option>
</select>
  </div>
  <div class="form-group">
<label>Nome</label>
<div class="controls">
  <input type="text" name="nome" class="form-control" required data-validation-required-message="Nome obrigatorio!">
</div>
  </div>
  <div class="form-group">
<label>Imagem destaque</label>
<div class="controls">
  <input name="arquivo" type="file" class="form-control" id="exampleInputFile" aria-describedby="fileHelp" required data-validation-required-message="Essa imagem é obrigatória!">
</div>
  </div>
  <div class="row">
<div class="col-lg-4">
  <div class="form-group">
    <label>Capacidade</label>
    <input name="capacidade" type="text" class="form-control" placeholder=".col-5">
  </div>
</div>
<div class="col-lg-4">
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    <label>Tamanho</label>
    <input name="tamanho" type="text" class="form-control" placeholder=".col-5">
  </div>
</div>
<div class="col-lg-4">
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    <label>Periodo Passeio</label>
    <input name="periodo_passeio" type="text" class="form-control" placeholder=".col-5">
  </div>
</div>
  </div>
  <div class="row">
<div class="col-lg-6">
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    <label>Area de Navegação</label>
    <input name="area_navegacao" type="text" class="form-control" placeholder=".col-5">
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</div>
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    <label>Motorização</label>
    <input name="motorizacao" type="text" class="form-control" placeholder=".col-5">
  </div>
</div>
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  <div class="form-group">
<label>Equipamentos</label>
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  <textarea name="equipamentos" id="texto-principal" class="textarea_editor form-control" rows="15" placeholder="Digitar o texto ..." required data-validation-required-message="Esse texto é obrigatório!"></textarea>
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<label>Descrição</label>
<textarea name="descricao" id="texto-extra2" class="textarea_editor form-control" rows="15" placeholder="Digitar o texto ..."></textarea>
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  <p>
<label>Galeria de Foto</label>
<BR>
<BR>
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  <div id="listas">
<div>
  <input name="fotos[]" type="file" class="form-control" aria-describedby="fileHelp" style="width: 70%;">
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